qPCR(定量聚合酶鏈反應(yīng))方法在檢測細(xì)胞樣品中的支原體時(shí)具有多個(gè)優(yōu)勢:
高靈敏度和特異性: qPCR能夠檢測極低濃度的核酸,使其對支原體的早期檢測更為敏感。引物的設(shè)計(jì)可以確保對目標(biāo)支原體的高度特異性,減少誤報(bào)和假陽性的可能性。
快速性: qPCR是一種高效的方法,通常在幾小時(shí)內(nèi)就能完成。這使得可以迅速獲取支原體存在的定量信息,為及時(shí)采取措施提供了可能。
定量能力: 與傳統(tǒng)PCR不同,qPCR可以提供關(guān)于支原體數(shù)量的定量信息,而不僅僅是檢測是否存在。這對于評估感染的程度和追蹤治療效果非常重要。
自動化和高通量: qPCR可以輕松集成到自動化平臺中,實(shí)現(xiàn)高通量的樣品處理。這使得可以同時(shí)處理大量樣品,提高檢測的效率。
實(shí)時(shí)監(jiān)測: qPCR是實(shí)時(shí)監(jiān)測反應(yīng)的技術(shù),能夠在擴(kuò)增過程中實(shí)時(shí)測量核酸的累積量。這有助于確定PCR反應(yīng)何時(shí)進(jìn)入指數(shù)增長階段,提高結(jié)果的準(zhǔn)確性。
低檢測限: qPCR的靈敏度使其能夠檢測非常低濃度的核酸,即使在樣品中支原體數(shù)量很少的情況下也能夠可靠地檢測到。
綜合來看,qPCR在檢測細(xì)胞樣品中的支原體方面具有高度敏感、定量準(zhǔn)確、快速高效等優(yōu)勢,使其成為支原體研究和臨床檢測中的重要工具。
在進(jìn)行qPCR檢測前,需要對樣品進(jìn)行處理。在處理過程中,以下幾個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)需要注意。
一般來說,樣品和標(biāo)準(zhǔn)品不應(yīng)長時(shí)間放置。這可能會損害標(biāo)準(zhǔn)品的恢復(fù)。
使用的反應(yīng)容器也會對樣品DNA提取造成影響,如果沒有使用低結(jié)合核酸反應(yīng)管,DNA最終容易粘在表面。
在提取DNA之前,將200µl樣品基質(zhì)在70℃下失活10分鐘是很重要的。培養(yǎng)基及其所含的FBS對PCR有抑制作用,無法檢測到標(biāo)準(zhǔn)品。
對于10cfu標(biāo)準(zhǔn)品,通過DNA提取對樣品進(jìn)行純化,對于NAT(核酸擴(kuò)增技術(shù))即傳統(tǒng)PCR或qPCR的后續(xù)擴(kuò)增具有重要意義。
體積不能偏離標(biāo)準(zhǔn)推薦量。如果改變了濃度因子,則有可能樣品基質(zhì)中不包含任何標(biāo)準(zhǔn)品。
如果出現(xiàn)以上幾種可能性,則標(biāo)準(zhǔn)品或樣品沒有被檢測的效果就會被放大。