實時定量聚合酶鏈式反應(qPCR)是一種高靈敏度、高精確度的分子生物學技術,用于檢測和量化DNA或RNA的數量。該項技術已經廣泛用于生物相關行業的檢測項目中,其中就包括支原體檢測。
我們都知道,支原體污染對于細胞相關的臨床項目危害巨大,支原體檢測是項目申報的必要環節。實現檢測的高靈敏度、高特異性,并盡可能縮短實驗時間,是非常有意義的。
藥典方法中,培養法和指示細胞法都各有缺點,而qPCR方法兼顧了二者的優點,受到眾多從業人員的青睞。那么在實驗過程中,有哪些注意事項?本期內容,以德國Minerva Biolabs公司生產的Venor Gem qEP為例,盤點qPCR檢測支原體的關鍵點。
Venor Gem qEP試劑盒能檢測多種支原體、靈敏度高、遵循歐洲藥典流程要求。
Part.01 樣品處理
一般來說,該試劑盒適用于細胞、細胞培養上清等物質的支原體檢測。
當細胞長至80%-90%時,收集樣品。此時可對樣品進行95℃的孵育處理。
需要注意的是:細胞培養產物中可能存在PCR抑制物質,例如:細胞顆粒、較大的樣品體積或其他生物材料(疫苗、石蠟包埋樣品等)、胎牛血清含量>5%等情況,需要在進行PCR之前,對樣品進行DNA提取處理,以盡可能減輕無關因素對實驗結果的干擾。
這里推薦試用配套的德國MB支原體提取試劑盒:
有小伙伴可能會產生疑問:培養基中的青霉素或者鏈霉素,會不會對實驗結果產生影響?
就目前有記錄的研究結果而言,沒有發現常用的“雙抗"會對檢測的靈敏度等造成影響。
Part.02 反應體系建立
在進行支原體qPCR檢測時,需要設置合適的反應體系和條件。反應體系包括Mix、樣品DNA、緩沖液、內控等組分。反應條件包括擴增溫度、時間、周期數和熒光信號閾值等參數。
需要注意的是:需嚴格按照使用說明中的參數進行設置。隨意更改數值可能會影響檢測結果的準確性。
Part.03 結果解釋
FAM通道:檢測支原體熒光信號。
HEX通道:檢測內控對照熒光信號。
需要注意的是:支原體DNA和內控DNA存在信號的競爭性抑制。支原體DNA越多,FAM通道信號越高,檢測內控對照的HEX通道信號越低。
定量需基于Ct值和DNA標準曲線。
Ct<40為陽性結果。Ct≥40為陰性結果。